데이터마이닝을 이용한 한우의 우수 지방산합성효소 유전자 조합 선별

Title
데이터마이닝을 이용한 한우의 우수 지방산합성효소 유전자 조합 선별
Other Titles
Major gene identification for FASN gene in Korean cattles by data mining
Author(s)
이제영김병두[김병두]김현지이성원[이성원]
Keywords
단일염기다형성; 데이터마이닝; 지방산합성효소; CART; CART; data mining; fatty acid synthase; single nucleotide polymorphism
Issue Date
201411
Publisher
한국데이터정보과학회
Citation
한국데이터정보과학회지, v.25, no.6, pp.1385 - 1395
Abstract
가축의 경제적인 특성은 환경적인 요인과 유전적인 요인의 영향을 받으며, 또한 하나의 유전자가 아닌 여러 유전자의 상호작용의 영향을 받는다고 알려져 있다. 본 논문에서는 선형회귀모형을 활용하여 환경적인 요인을 보정한 자료로 한우의 맛과 육질에 영향을 준다고 밝혀진 지방산합성효소의 단일염기다형성 5개를 이용해 한우의 경제 형질에 영향을 미치는 우수 유전자 조합을 선별하고 우수 유전자형을 밝힌다. 이를 위해 데이터마이닝 기법인 인공신경망, 로지스틱 회귀모형, C5.0, CART 기법을 이용하였다. 공정한 모형 평가를 위해 전체 데이터를 훈련용 데이터 (60%)와 검증용 데이터 (40%)로 나누었고, 훈련용 데이터에서 설정된 모형을 검증용 데이터에 적용시켜 정확도를 비교하였다. 그 결과 C5.0이 최적 모형으로 선정되었으며, C5.0의 의사결정나무를 통해 우수 유전자 조합을 선별하였다.
URI
http://hdl.handle.net/YU.REPOSITORY/30404http://dx.doi.org/10.7465/jkdi.2014.25.6.1385
ISSN
1598-9402
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