EPs-TFP 마이닝 기법을 이용한 단백질 Disorder/Order 지역 분류

Title
EPs-TFP 마이닝 기법을 이용한 단백질 Disorder/Order 지역 분류
Other Titles
Protein Disorder/Order Region Classification Using EPs-TFP Mining Method
Author(s)
신용호이헌규[이헌규]
Keywords
출현패턴; TFP-트리; 단백질 Disorder/Order 구역; 데이터 마이닝
Issue Date
201212
Publisher
한국산업정보학회
Citation
한국산업정보학회논문지, v.17, no.6, pp.59 - 72
Abstract
단백질은 서열의 disorder 구역이 생물학적 반응을 일으켜 order로 변하는 과정에서 그 기능을 하게 되므로 서열 데이터에서 disorder 구역과 order 구역을 분리하는 것은 단백질의 3차 구조 및 특성을 예측하는데 반드시 필요하다. 따라서 이 논문에서는 효율적인 disorder와 order 구역 분류를 위해서 단백질의 특정 특징에 치우치지 않는 분류 결과를 얻으면서, 분류 속도를 향상 시킬 수 있도록 서열 데이터를 이용한 분류/예측 기법을 제안한다. 출현패턴 기반의 EPs-TFP 기법은 중복 출현패턴이 제거된 필수 출현패턴만을 이용하는 분류/예측 기법이다. 이 분류 기법은 disorder 구역의 서열 출현패턴들을 발견하며, 이러한 서열 출현패턴은 disorder 구역에서는 빈발하지만 order 구역에서는 상대적으로 빈발하지 않는 패턴들이다. 또한 제안 알고리즘의 성능 향상을 위해서 기존의 P-tree, T-tree 개념의 TFP 기법을 확장하여 분류/예측 기법으로 적용하였다. EPs-TFP 기법의 성능평가를 위해서 Disprot 4.9와 CASP 7 데이터를 활용하였고, disorder/order 구역을 분류한 결과, 민감도 73.6, 특이도 69.5, 정확도 74.2를 보였다.
URI
http://hdl.handle.net/YU.REPOSITORY/26506http://dx.doi.org/10.9723/jksiis.2012.17.6.059
ISSN
1229-3741
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경영대학 > 경영학과 > Articles
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