연속형 자료의 유전자 상호작용 규명을 위한 SVM MDR과 D-MDR의 방법 비교

Title
연속형 자료의 유전자 상호작용 규명을 위한 SVM MDR과 D-MDR의 방법 비교
Other Titles
A Comparison Study on SVM MDR and D-MDR for Detecting Gene-Gene Interaction in Continuous Data
Author(s)
이제영이종형[이종형]
Keywords
Gene-gene interaction; MDR method; SNP; SVM algorithm; Dummy MDR; Multifactor Dimensionality Reduction(MDR); SVM; 종합경제형질
Issue Date
201107
Publisher
한국통계학회
Citation
Communications for Statistical Applications and Methods, v.18, no.4, pp.413 - 422
Abstract
유전학에서 유전자 상호작용효과 규명을 위한 방법으로 비모수적인 방법인 Multifactor Dimensionality Reduction(MDR) 방법이 제안되어 현재까지 사용되고 있다. MDR 방법은 이분형 자료에 적합한 방법으로 연속형 자료에는 적용할 수 없는 단점이 있다. 이러한 한계를 극복하기 위해서 Dummy MDR(D-MDR) 방법 그리고 SVM을 활용한 MDR(SVM MDR) 방법 등이 제안 되었다. 본 논문에서는 연속형 자료에 적용 가능한 SVM MDR 방법과 D-MDR 방법을 비교하고, 실제 한우 데이터에 두 방법에 적용한다. 그리고 각 방법의 적용결과를 바탕으로 한우의 종합경제형질에 영향을 주는 유전자 상호작용 조합을 규명한다. 그리고 마지막으로 기존의 SVM MDR 방법과 D-MDR 방법의 장단점 비교를 통해서 추후 새로운 연구방향을 제시한다.
URI
http://hdl.handle.net/YU.REPOSITORY/24823
ISSN
2287-7843
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이과대학 > 통계학과 > Articles
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